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A cidade de Nova York mal testa variantes do vírus. Isso pode mudar?

“Nossas máquinas podem lidar com milhares ou centenas de milhares”, disse o Dr. Neville Sanjana, um cientista com um laboratório no New York Genome Center em Lower Manhattan. “Portanto, a capacidade não é o problema.”

O problema para os laboratórios de pesquisa, curiosamente, em meio a uma pandemia que provavelmente infectou mais de um quarto dos nova-iorquinos, é o acesso às amostras. Em Nova York, não há uma linha de grande volume de amostras positivas para vírus de hospitais ou locais de teste para laboratórios de pesquisa para vigilância genética.

“Na verdade, trata-se apenas de organizar essa coleção de amostras, acho que é isso que está faltando”, disse Sanjana, cuja pesquisa envolveu a análise de quais drogas poderiam bloquear a infecção inibindo genes humanos que o coronavírus sequestra.

O que é necessário, disseram os cientistas em entrevistas, é que a cidade ou outra entidade basicamente bifurque o atual processo de teste do coronavírus. Todos os dias, dezenas de milhares de nova-iorquinos fornecem amostras de cotonete, que normalmente são enviadas a alguns grandes laboratórios para teste. Se esses laboratórios pudessem reservar uma parte das amostras, essas partes poderiam mais tarde ser usadas para o sequenciamento do genoma, caso fossem positivas.

“É solucionável, mas você precisa de recursos e pessoas para coordenar”, disse o professor Heguy, ao listar as etapas necessárias: uma parte da amostra original deve ser reservada; O RNA precisaria ser isolado dele; e alguém precisaria transportar as amostras de RNA para um laboratório que faz o sequenciamento do genoma.

A meta da cidade de expandir o sequenciamento em pelo menos dez vezes exigirá a contratação de uma variedade de laboratórios externos e projetos de pesquisa, grandes e pequenos. A cidade prevê que a maior parte do sequenciamento genômico ocorrerá em um laboratório em Long Island City, Queens, que é administrado por uma pequena empresa de robótica.

A empresa Opentrons também tem uma instalação em Manhattan chamada Laboratório de Resposta à Pandemia. Aquele lab foi construído no ano passado para ajudar a cidade resolver a crise de testes que surgiu durante o verão, quando grandes laboratórios comerciais eles estavam lutando para lidar com o enorme número de casos. As pessoas tiveram que esperar vários dias, às vezes uma ou duas semanas, para obter os resultados dos testes do coronavírus. O laboratório agora analisa 20.000 amostras por dia.

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