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Como as variantes do coronavírus se propagam na cidade de Nova York

O número de novos casos de coronavírus na cidade de Nova York permaneceu alarmante e teimosamente alto por semanas, mesmo com dezenas de milhares de pessoas sendo vacinadas diariamente.

Uma razão provável é que as variantes mais contagiosas substituíram as formas originais do vírus, disseram autoridades de saúde pública. mais de 75 por cento de novos casos, segundo análise recente.

A cada semana, o Departamento de Saúde publica os resultados de uma amostra de até 1.500 casos sequenciados, fornecendo uma visão geral das variantes que estão aumentando em toda a cidade.

Até esta semana, a cidade não havia informado quais variantes eram mais comuns em quais bairros. Mas os dados de nível de código postal recentemente disponíveis fornecem uma visão sobre a mistura de variantes que circulam na área.

A informação serve como um lembrete vívido de que a dinâmica da epidemia de Nova York mudou nos últimos meses e que as formas originais do vírus estão se tornando cada vez mais raras na cidade.

“Isso torna algo que era bastante abstrato e talvez menos acessível muito mais tangível para as pessoas”, disse o Dr. Denis Nash, epidemiologista da Escola de Pós-Graduação em Saúde Pública e Políticas de Saúde da CUNY, sobre os dados. “A paisagem está mudando rapidamente.”

Uma variante descoberto pela primeira vez em Nova York, B.1.526, se espalhou mais amplamente na cidade do que todos os outros até agora. Também houve um aumento significativo nos casos relacionados à variante B.1.1.7, que foi detectada pela primeira vez na Grã-Bretanha no ano passado e agora é responsável por quase 30% dos novos casos sequenciados na cidade de Nova York.

A variante B.1.1.7 causou novas ondas de doença da Polônia a Michigan. Estima-se que seja 60% mais contagioso. e dois terços mais mortal do que a forma original do vírus. Essa variante é agora a principal fonte de novas infecções. nos Estados Unidos Y na Europa.

Mas não na cidade de Nova York, onde B.1.526 continua sendo a variante mais prevalente, compreendendo cerca de 45 por cento dos casos sequenciados na quarta semana de março.

Muitas perguntas sobre B.1.526, como se causa uma doença mais séria ou se pode escapar da proteção conferida pelas vacinas, permanecem sem resposta.

Quanto a qual é mais contagioso, B.1.1.7 ou B.1.526, os funcionários de saúde ainda não têm certeza. “Não temos informações suficientes para discernir isso neste momento”, disse o comissário de saúde da cidade, Dr. Dave Chokshi.

Em Queens, Manhattan e Brooklyn, a variante B.1.526 foi responsável por mais de 50 por cento de todos os casos sequenciados entre 16 de março e 1º de abril. No Bronx, a proporção de B.1.526 foi de 61 por cento.

Um dos poucos lugares onde B.1.1.7 parece responsável pela maioria dos casos foi ao longo da ponta sul de Staten Island, que lutou com um grande número de casos por meses e atualmente tem algumas das maiores taxas de positividade. a cidade.

Em Staten Island, B.1.1.7 foi responsável por 40 por cento dos novos casos sequenciados entre 16 de março e 1º de abril. No Queens, Brooklyn e Manhattan, B.1.1.7 representou uma parcela menor, representando 26 a 29 por cento nesses bairros. No Bronx, B.1.1.7 foi responsável por apenas 23 por cento dos casos sequenciados.

Apesar do predomínio de variantes, as internações não aumentaram na cidade nas últimas semanas, e na verdade estão em uma ligeira descida. E os casos se mantiveram estáveis, embora em patamar elevado. “Isso é reconfortante para mim”, disse o Dr. Wafaa El-Sadr, epidemiologista da Escola Mailman de Saúde Pública da Universidade de Columbia. “Podemos estar vendo o início do efeito de uma vacina.”

Em uma semana, entre um e dois mil casos positivos de coronavírus são sequenciados na cidade de Nova York, ou seja, o material genético do vírus é examinado em busca de mutações. Isso representa cerca de quatro a oito por cento dos novos casos da cidade de Nova York. A maioria desses casos é sequenciada em um laboratório em Long Island City operado pela Opentrons, uma empresa de robótica.

A pedido do The Times, o CEO da empresa, Jonathan Brennan-Badal, compartilhou dados no nível do código postal para aproximadamente 7.500 casos sequenciados, explicando que as informações poderiam ajudar a identificar onde a necessidade de mais recursos era maior, incluindo testes e vacinações. .

O Departamento de Saúde da cidade usa as sequências deste laboratório, conhecido como Laboratório de Resposta à Pandemia, como base para sua amostra semanal medindo a prevalência de cada variante.

Mas mesmo com milhares de amostras sequenciadas, os dados ainda têm limitações significativas. A maioria das amostras de coronavírus vem do sistema de hospitais públicos da cidade e de locais de teste patrocinados pela cidade. Receba muitas amostras de alguns bairros, mas poucas de outros.

“O número limitado de variantes sequenciadas até agora torna difícil tirar conclusões sobre se alguns bairros são mais afetados do que outros”, disse o Dr. El-Sadr.

Cada ponto nos mapas de densidade acima é colocado no código postal de um nova-iorquino cuja amostra de coronavírus foi sequenciada no laboratório Opentrons. Mas os bairros com muitos pontos não correspondem necessariamente aos pontos quentes do coronavírus. A densidade de pontos geralmente pode ser explicada pela presença de um centro de testes de uma cidade próxima.

Por outro lado, bairros com poucos pontos não são necessariamente livres de variantes. Significa apenas que poucas amostras de coronavírus de lá chegaram ao laboratório.

Existem pontos cegos no Bronx, no Queens e na metade sul de Manhattan. Em alguns códigos postais, poucas amostras foram sequenciadas para tirar conclusões sólidas. Na Ilha Roosevelt, por exemplo, apenas um caso foi sequenciado.

A cidade na segunda-feira separadamente liberado um relatório baseado em dados de nível de código postal do Laboratório de Resposta à Pandemia, bem como do próprio laboratório da cidade. Também mostrou que a proporção de casos B.1.1.7 e B.1.526 estava crescendo rapidamente.

O relatório disse que casos B.1.526 foram detectados em todos os cinco distritos, mas foram um pouco mais comuns no Bronx e partes de Queens. B.1.1.7 Casos também foram encontrados em toda a cidade, mas eram um pouco mais comuns no sul do Brooklyn, leste do Queens e Staten Island.

Autoridades municipais disseram que os mapas mostram a transmissão generalizada das variantes e são um lembrete importante para as pessoas não baixarem a guarda em nenhum bairro.

“A melhor maneira de lidar com essa ameaça é vacinar todos o mais rápido possível”, disse o Dr. Jay Varma, conselheiro sênior de saúde pública do gabinete do prefeito. “A realidade é que você corre o risco de qualquer um desses, não importa onde esteja.”

O Dr. Chokshi disse que a divisão geográfica das variantes ilustra onde as variantes foram detectadas e como elas estavam espalhadas pela cidade – questões que as autoridades de saúde vinham fazendo há semanas.

Grupos de monitoramento em certos bairros podem levar a ideias sobre variantes que até agora eram um mistério para as autoridades de saúde.

Como B.1.526 parece ter surgido localmente na cidade de Nova York, o Dr. Nash disse que esperava que circulasse mais em áreas com altos níveis de transmissão na comunidade.

Durante a pandemia, essas áreas tendem a ser as áreas mais pobres da cidade, onde as condições de vida são mais lotadas e os empregos exigem comparecimento pessoal. O mapa confirma isso em grande parte.

Em códigos postais onde mais de 20 por cento da população vive na pobreza, houve aproximadamente três vezes mais casos B.1.526 sequenciados do que casos B.1.1.7 entre 1 ° de março e 1 ° de abril. Em códigos postais com menos pobreza, B. 1.526 casos eram duas vezes mais numerosos que B.1.1.7.

Em um efeito reverso, taxas de vacinação eles também tendem a ser mais baixos nos bairros mais afetados que tiveram mais transmissão na comunidade durante a pandemia. Parte disso é devido às vacinações e alguns a problemas de acesso. A cidade tem tentado resolver isso com campanhas de vacinação direcionadas.

“A escassez é inimiga da equidade”, disse o Dr. Tom Frieden, ex-comissário de saúde da cidade.

A abundância de variantes detectadas na cidade criou um desafio complicado para as autoridades de saúde.

Algumas variantes, como as primeiras encontradas no Brasil, P.1, e na África do Sul, B.1.351, que agora estão aparecendo em pequenos números em Nova York, carregam uma mutação que parece permitir que o vírus contorne parcialmente os anticorpos da infecção anterior A variante encontrada pela primeira vez na África do Sul também parece tornar as vacinas menos eficazes.

A variante detectada pela primeira vez em Nova York, B.1.526, parece vir com duas formas de mutação.

Mais da metade de B.1.526 circulando na cidade de Nova York agora carrega uma mutação semelhante àquelas carregadas pelas variantes descobertas na África do Sul e no Brasil, de acordo com o Departamento de Saúde da cidade de Nova York.

Outra versão da variante, dizem os pesquisadores, contém uma mutação diferente, que pode ajudar o vírus a se ligar mais às células humanas e torná-lo mais contagioso. No entanto, ainda não há evidências reais de que B.1.526 resulte em uma infecção mais séria, ou seja mais provável de prevenir anticorpos de infecções anteriores ou vacinas, embora esteja sendo estudado, disseram as autoridades municipais.

A variante P.1, que tem sido associada a um aumento de casos no Brasil, foi detectada cerca de duas dezenas de vezes na cidade de Nova York entre 16 de março e 1º de abril, principalmente no Queens. Um punhado de casos B.1.351 foram encontrados principalmente em Staten Island nas últimas semanas.

“É apenas um lembrete de que não estamos apenas interconectados na cidade, mas estamos interconectados em todo o mundo”, disse o Dr. Nash, “e o que acontece lá pode acontecer aqui também, se não tivermos cuidado”.

Lauren Leatherby contribuiu com a pesquisa.

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