CENTROS DE CONTROLE E PREVENÇÃO DE DOENÇAS. Anuncia “Avanço” de US $ 200 milhões para rastrear variantes de vírus

Enquanto legisladores pressionam por bilhões de dólares para financiar os esforços do país para rastrear variantes do coronavírus, o governo Biden anunciou na quarta-feira um novo esforço para acelerar esse trabalho, prometendo quase US $ 200 milhões para identificar melhor as ameaças emergentes.

Chamando isso de “entrada”, a Casa Branca disse que o investimento resultaria em um aumento significativo no número de amostras de vírus positivas que os laboratórios poderiam sequenciar. Laboratórios de saúde pública, universidades e programas administrados pelos Centros de Controle e Prevenção de Doenças sequenciaram mais de 9.000 genomas na semana passada, de acordo com o banco de dados. GISAID. A agência espera aumentar sua própria contribuição para 25.000 genomas por semana.

“Quando chegarmos a 25.000, depende dos recursos que temos ao nosso alcance e da rapidez com que podemos mobilizar nossos parceiros”, disse a Dra. Rochelle Walensky, C.D.C. diretor, disse ele em entrevista coletiva na Casa Branca na quarta-feira. “Não acho que seja um interruptor de luz. Acho que vai ser um dial. “

O programa é o esforço mais significativo da administração até o momento para lidar com o perigo iminente de variantes mais contagiosas do vírus. Uma variante preocupante identificada pela primeira vez na Grã-Bretanha infectou pelo menos 1.277 pessoas em 42 estados, embora os cientistas suspeitem que o número real seja muito maior.

Dobrando aproximadamente a cada 10 dias, a variante B.1.1.7 que surgiu na Grã-Bretanha ameaça desacelerar ou reverter o rápido declínio em novos casos de coronavírus. Além do mais, o Dr. Walensky disse que a nação viu seu primeiro caso de B.1.1.7 que ganhou uma mutação particularmente preocupante que foi mostrada na África do Sul para reduzir a eficácia das vacinas.

Outras variantes preocupantes também surgiram nos Estados Unidos, incluindo uma que foi encontrada pela primeira vez na África do Sul e enfraquece as vacinas.

O F.D.A. é preparando para um possível redesenho de vacinas para melhor proteção contra novas variantes, mas esses esforços levarão meses. No curto prazo, dizem os especialistas, é fundamental aumentar os esforços de sequenciamento, que são muito pequeno e descoordenado para rastrear adequadamente onde e com que rapidez as variantes estão se espalhando.

Os cientistas saudaram os novos planos do governo Biden. “É um grande passo na direção certa”, disse Bronwyn MacInnis, geneticista do Broad Institute.

O Dr. MacInnis disse que o “padrão ouro mínimo” seria sequenciar 5% das amostras de vírus. Se os casos continuarem a cair, então 25.000 genomas por semana trariam o país perto desse limite, disse ele, que é “onde precisamos estar para detectar não apenas ameaças conhecidas, mas ameaças emergentes”.

Trevor Bedford, biólogo evolucionista do Fred Hutchinson Cancer Research Center, disse que “progresso substancial” foi feito nos esforços de sequenciamento nacional desde dezembro. Ainda assim, ele disse que o C.D.C. Também precisaria fazer melhorias na coleta de dados sobre genomas, como vinculá-los a informações de rastreamento de contato e, em seguida, apoiar a análise em grande escala em computadores necessários para dar sentido rapidamente a tudo.

“Há muito foco na contagem bruta que estamos sequenciando, ao invés do tempo de resposta”, disse ele.

Funcionários da Casa Branca vêem o aumento da sequência como parte de um esforço mais amplo para testar mais americanos para o vírus. O Departamento de Saúde e Serviços Humanos e o Departamento de Defesa anunciaram na quarta-feira novos investimentos substanciais em testes, incluindo US $ 650 milhões para escolas primárias e secundárias e “ambientes congregados negligenciados”, como abrigos para sem-teto. Os dois departamentos também estão investindo US $ 815 milhões para acelerar a fabricação de suprimentos de teste.

O investimento sequencial de US $ 200 milhões do CDC é ofuscado por um programa proposto por alguns legisladores como parte de um pacote de ajuda financeira que os líderes democratas no Congresso pretendem aprovar antes de meados de março. A senadora Tammy Baldwin, democrata de Wisconsin, apresentou uma legislação para melhorar seus esforços de sequenciamento. Os legisladores da Câmara alocaram US $ 1,75 bilhão para o esforço.

Em uma entrevista, Baldwin sugeriu que o governo deveria ter como objetivo sequenciar 15% das amostras de vírus positivas, uma meta muito além do que os pesquisadores acreditam ser possível a curto prazo.

“Pretende-se com isso criar a base de uma infraestrutura permanente que nos permita não só fazer vigilância para a Covid-19, para estar na vanguarda na descoberta de novas variantes, mas também ter essa capacidade para outras doenças”. ele disse de sua proposta. “Existem lacunas significativas em nosso conhecimento.”

Em uma entrevista, a nova coordenadora de testes da administração Biden, Carole Johnson, disse que o investimento de US $ 200 milhões foi um “pagamento inicial” e apenas o começo do que provavelmente seria uma campanha muito mais agressiva para rastrear variantes.

“É isso que podemos olhar: Quais são os recursos que temos disponíveis neste momento? O que podemos encontrar para agir rapidamente? “ela disse.” Mas saiba que precisamos de mais investimentos no futuro e de uma forma sistemática de fazer este trabalho. “

Desde 2014, o Escritório de Detecção Molecular Avançada do C.D.C. tem usado o sequenciamento do genoma para rastrear doenças como a influenza, H.I.V. e doenças de origem alimentar. Mas quando a pandemia de coronavírus atingiu os Estados Unidos, o C.D.C. Foi lento para adaptar essas ferramentas para rastrear o coronavírus. Durante semanas, ele lutou simplesmente para estabelecer um teste para o vírus.

Em contraste, a Grã-Bretanha começou um programa de sequenciamento amplamente elogiado em março passado, aproveitando seu sistema de saúde nacionalizado com um laboratório central de genômica. Agora ele sequencia até 10% de todos os testes de coronavírus positivos e oferece uma análise rápida e profunda dos resultados.

O C.D.C. começou a intensificar os esforços de vigilância ao longo de 2020, ajudando laboratórios acadêmicos, empresas de sequenciamento comercial e departamentos de saúde pública a colaborar e compartilhar conhecimento. Em novembro, investiu em um programa próprio, denominado NS3, para analisar os genomas do coronavírus. A cada duas semanas, a agência pede aos departamentos de saúde estaduais que enviem pelo menos 10 amostras ao seu laboratório para sequenciamento.

Em dezembro, ficou claro que esses esforços não seriam suficientes. Pesquisadores na Grã-Bretanha encontraram uma nova variante, chamada B.1.1.7, que era até 50 por cento mais transmissível do que outras variantes. Os cientistas agora suspeitam que provavelmente é mais mortal também. Na África do Sul, outra variante chamada B.1.351 não era apenas mais contagiosa, mas menos vulnerável a várias vacinas.

CENTROS DE CONTROLE E PREVENÇÃO DE DOENÇAS. as autoridades começaram a temer que B.1.1.7 já tivesse se espalhado amplamente nos Estados Unidos, de acordo com um alto funcionário federal de saúde. Eles começaram a estabelecer novos esforços, incluindo contratos com empresas de testes de laboratório que realizavam testes de coronavírus.

O Dr. Gregory Armstrong, diretor do Programa de Detecção Molecular Avançada, disse em uma entrevista que sua equipe concluiu em janeiro que sequenciar 5.000 a 10.000 amostras por semana seria uma boa meta de curto prazo.

“É o ponto de partida”, disse o Dr. Armstrong. “Quanto mais sequenciamos acima disso, mais rápido podemos pegar essas variantes.”

Em uma entrevista coletiva na Casa Branca no final daquele mês, Jeffrey D. Zients, o coordenador de resposta da Covid-19 da Casa Branca, reconheceu como essa meta seria difícil de atingir.

“Estamos em 43º lugar no ranking mundial em sequenciamento genômico, totalmente inaceitável”, afirmou, citando dados de dezembro GISAID base de dados. Em uma entrevista posterior, ele se corrigiu dizendo que os Estados Unidos estavam atrás de 31 outras nações.

Nos primeiros dias da administração, o Dr. Walensky falou de uma meta inicial para o C.D.C. de sequenciamento de 7.000 genomas por mês. Desde então, os laboratórios não chegaram perto desse número.

A agencia Painel de controle de vigilância genômica nacional mostraram que eles registraram apenas 96 genomas na semana de 6 de fevereiro. Na semana seguinte, o número aumentou para 1.382 genomas. A nova meta do Dr. Walensky de 25.000 genomas por semana exigirá um aumento significativo.

Caitlin Rivers, epidemiologista da Escola de Saúde Pública Bloomberg da Universidade Johns Hopkins, disse que investir US $ 200 milhões rapidamente no monitoramento de variantes foi um desenvolvimento bem-vindo antes do que ela esperava que fossem melhorias de longo prazo. “O tempo é essencial”, disse ele. “Um investimento inicial para expandir a vigilância genômica ao mesmo tempo em que combina o pacote de financiamento suplementar é uma jogada inteligente.”

Mas ele alertou que o plano não poderá entrar em ação instantaneamente. Pode levar um mês apenas para implementar as melhorias básicas. Até então, B.1.1.7 já pode dominar os casos dos EUA e pode prejudicar o declínio atual.

O programa mais amplo do pacote de estímulo será crucial para gerenciar a pandemia a longo prazo, disse o Dr. Rivers.

“Podemos não ser capazes de ir muito longe quando se trata de B.1.1.7, mas o que vem a seguir, em três meses, seis meses ou no próximo inverno?” ela perguntou. “Nem sempre é apenas o que você tem na sua frente. É o que está virando a esquina. “